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Les milieux naturels (ou semi-naturels) et forestiers ne représentaient que 15.8% du territoire régional en 2011.

À l’inverse, 17.2% sont des infrastructures ou des zones bâties (voir la page occupation du sol). Entre 2005 et 2009, la région a perdu 9 000 hectares (soit 1 800 hectares par an) de terres agricoles et de milieux naturels au profit d’un étalement urbain toujours croissant (source : Sigale 2009). Enfin, la majorité (près de 67%) des espaces sont occupés par les terres agricoles, dont l’intérêt pour la biodiversité est variable selon qu’il s’agit de prairies ou de cultures et selon le mode d’exploitation.