L’Agence met en œuvre des dispositifs d’aides dans des secteurs très variés tels que :
l’agriculture, l’aquaculture, la forêt, la pêche, l’emploi, l’éducation et la formation professionnelle, l’insertion, l’intégration, la solidarité et l’action sociale, l’aménagement du territoire, le développement local et rural, la protection de l’environnement et la promotion du développement durable, l’aménagement foncier outre mer